Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vta1Q9CR26 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Vta1Q9CR26 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vta1Q9CR26 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms