Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pop4Q9CR08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pop4Q9CR08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms