Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg3Q9CPX6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms