Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npm3Q9CPP0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Npm3Q9CPP0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npm3Q9CPP0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms