Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim26Q99PN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms