Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim8Q99PJ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim8Q99PJ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim8Q99PJ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms