Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a6cQ99N08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a6cQ99N08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms