Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramel1Q99MW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel1Q99MW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel1Q99MW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms