Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PccbQ99MN9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PccbQ99MN9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms