Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprtQ99M80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprtQ99M80 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
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PtprtQ99M80 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
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PtprtQ99M80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
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PtprtQ99M80 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PtprtQ99M80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
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PtprtQ99M80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprtQ99M80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
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