Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1aQ99L02 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1aQ99L02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms