Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmp1Q99KU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmp1Q99KU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms