Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmagpQ99KC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmagpQ99KC7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms