Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnip2Q99JG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip2Q99JG7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip2Q99JG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms