Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln1Q99J21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mcoln1Q99J21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms