Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim11aQ99J19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim11aQ99J19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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