Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctu1Q99J10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctu1Q99J10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctu1Q99J10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctu1Q99J10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctu1Q99J10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctu1Q99J10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctu1Q99J10 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms