Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atad3Q925I1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atad3Q925I1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms