Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim59Q922Y2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim59Q922Y2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms