Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Clip1Q922J3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Clip1Q922J3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Clip1Q922J3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clip1Q922J3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms