Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HlcsQ920N2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HlcsQ920N2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HlcsQ920N2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms