Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsqQ91ZF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsqQ91ZF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsqQ91ZF4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsqQ91ZF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms