Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Atl3Q91YH5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atl3Q91YH5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms