Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zkscan3Q91VW9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zkscan3Q91VW9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms