Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng5Q8VHW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacng5Q8VHW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms