Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc71Q8VEG0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms