Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmcd1Q8VEE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmcd1Q8VEE1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms