Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
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