Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxn4Q8K3Q3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxn4Q8K3Q3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms