Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh16f2Q8K3M1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rdh16f2Q8K3M1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rdh16f2Q8K3M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Rdh16f2Q8K3M1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rdh16f2Q8K3M1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh16f2Q8K3M1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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