Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Depp1Q8K2F3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Depp1Q8K2F3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms