Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil3Q8K203 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil3Q8K203 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil3Q8K203 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms