Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms