Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cc2d2aQ8CFW7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cc2d2aQ8CFW7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cc2d2aQ8CFW7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cc2d2aQ8CFW7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms