Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hpf1Q8CFE2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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