Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup88Q8CEC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup88Q8CEC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms