Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc17Q8CE13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms