Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc178Q8CDV0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms