Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms