Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf31Q8CCF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf31Q8CCF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms