Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac7Q8C2B3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac7Q8C2B3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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