Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pm20d1Q8C165 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pm20d1Q8C165 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pm20d1Q8C165 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pm20d1Q8C165 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pm20d1Q8C165 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pm20d1Q8C165 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pm20d1Q8C165 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms