Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef5Q8C0Q9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef5Q8C0Q9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms