Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip1Q8C079 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Strip1Q8C079 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Strip1Q8C079 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms