Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Trerf1Q8BXJ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Trerf1Q8BXJ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Trerf1Q8BXJ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trerf1Q8BXJ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Trerf1Q8BXJ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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