Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skor1Q8BX46 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skor1Q8BX46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms