Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx1bQ8BX32 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx1bQ8BX32 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms