Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk3Q8BWQ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk3Q8BWQ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk3Q8BWQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms