Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms