Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQC3

Igdcc3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc3Q8BQC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igdcc3Q8BQC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Igdcc3Q8BQC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igdcc3Q8BQC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms